Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PEX7O00628 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PEX7O00628 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PEX7O00628 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PEX7O00628 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PEX7O00628 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms