Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GFRA2O00451 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GFRA2O00451 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms