Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms