Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GOLGA8SH3BPF8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms