Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms