Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HMGB1P1B2RPK0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HMGB1P1B2RPK0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms