Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FER1L4A9Z1Z3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FER1L4A9Z1Z3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FER1L4A9Z1Z3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms