Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM200CA6NKL6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms