Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF316A6NFI3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms