Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms