Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms