Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RAB39AQ14964 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms