Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTCH1Q13635 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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