Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 STEAP3-AS1-201ENST00000454260 3218 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TAPT1-AS1-203ENST00000573950 510 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC012354.1-201ENST00000425325 2685 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ZNF185-201ENST00000318504 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 MCTP1-201ENST00000312216 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 HS3ST5-202ENST00000411826 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LSMEM1-201ENST00000312849 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TMPPE-202ENST00000416695 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC011297.1-201ENST00000620503 2110 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms