Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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