Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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TCIRG1Q13488 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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