Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 KCNK10-203ENST00000340700 7501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 TNC-203ENST00000423613 6281 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SEMA3E-201ENST00000307792 6476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 AC008938.1-201ENST00000566929 6510 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 YWHABP1-201ENST00000445359 727 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PKHD1P08F94 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ZNF592-203ENST00000560079 8131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PKHD1P08F94 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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