Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AMYH02020865.1-201ENST00000621140 2591 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LIN9-205ENST00000481685 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 WDR19-201ENST00000399820 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZNF20-201ENST00000334213 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 GJB2-201ENST00000382844 2309 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TTC23-202ENST00000394129 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC00310-204ENST00000430922 2086 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC093117.1-201ENST00000413541 2171 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ANKS1B-201ENST00000329257 996 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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