Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
TTF2Q9UNY4 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TTF2Q9UNY4 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms