Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ELP4-229ENST00000640961 8164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms