Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC026979.2-201ENST00000523733 583 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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