Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ADAM2-202ENST00000347580 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IFIT5-201ENST00000371795 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL807761.4-201ENST00000439901 2277 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PCDHGA4-201ENST00000571252 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LILRB5-201ENST00000316219 3236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC01346-201ENST00000412674 3242 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC008555.2-202ENST00000601776 5302 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRBV20-1-201ENST00000390394 413 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC009494.1-201ENST00000406090 455 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC012065.1-201ENST00000441870 686 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNRPCP10-201ENST00000481033 210 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SL169P-201ENST00000485643 289 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AP000851.1-201ENST00000544115 743 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NAMA-204ENST00000604258 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL157815.1-201ENST00000635484 2117 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 DEF8-229ENST00000617948 3883 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SIX1-201ENST00000247182 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 POTEH-203ENST00000621704 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 ZNF473-201ENST00000270617 4688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ERICH6B-201ENST00000298738 2421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF738-201ENST00000311015 2442 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LPA-202ENST00000447678 1839 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SL735P-201ENST00000471015 292 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NR1I3-217ENST00000502985 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TSC22D3-216ENST00000514426 569 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNA5SP414-201ENST00000516580 136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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