Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 SUN5-201ENST00000356173 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 USP32P1-202ENST00000393005 3846 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 VDAC1P5-201ENST00000603132 844 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 DNAJC18-201ENST00000302060 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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CNTNAP3Q9BZ76 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNTNAP3Q9BZ76 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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