Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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ANKRD42Q8N9B4 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ANKRD42Q8N9B4 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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