Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 VNN3-201ENST00000275223 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NHP2P2-201ENST00000396362 460 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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TOP3AQ13472 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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