Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ODF2L-201ENST00000294678 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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