Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
BPTFQ12830 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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