Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AP3B2-209ENST00000542200 3921 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRPM6-201ENST00000359047 1568 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LPIN1-203ENST00000396098 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 DCAF13-208ENST00000612750 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC013643.3-201ENST00000623825 2596 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FOXN4-201ENST00000299162 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PADI1-201ENST00000375471 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 BCL6-206ENST00000450123 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PPP2R2B-208ENST00000504198 2011 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL645937.5-201ENST00000642091 1883 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC078925.3-201ENST00000623434 2500 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SDAD1P1-201ENST00000519902 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SNORA70.1-201ENST00000363367 141 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RN7SKP134-201ENST00000363960 269 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ILF2P1-201ENST00000486302 1168 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TMEM92-202ENST00000507382 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MICE-207ENST00000510438 1157 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF780B-206ENST00000598845 401 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRMT112P7-201ENST00000603133 367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SLC8A1-206ENST00000406391 2814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PIK3R1-216ENST00000523872 2473 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ADAM21P1-202ENST00000530196 2049 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ADGRG1-267ENST00000568909 4254 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC068491.4-201ENST00000622940 3380 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ALK-207ENST00000642122 2513 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 CHODL-207ENST00000543733 1637 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LCTL-202ENST00000537670 2552 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ACACB-201ENST00000338432 9360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AP000695.3-201ENST00000624669 1894 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LAMB4-203ENST00000418464 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PCDHGB4-201ENST00000519479 4578 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SLC12A8-201ENST00000393469 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MSRA-210ENST00000528246 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL136526.1-201ENST00000624456 2203 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LINC00346-201ENST00000538077 6265 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NR4A1-206ENST00000545748 3511 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HMGCLL1-205ENST00000398661 2532 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RAD54L-202ENST00000442598 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ZNF18-202ENST00000454073 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRBV7-6-201ENST00000390374 392 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TRAV20-201ENST00000390448 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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