Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 UBQLN3-201ENST00000311659 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL513548.3-201ENST00000611708 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 C2orf42-205ENST00000420306 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 GAS8-AS1-201ENST00000408886 435 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 LINC02090-201ENST00000419151 400 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL135908.1-202ENST00000454135 562 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 RNF185-AS1-201ENST00000526089 353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC020908.2-201ENST00000595134 405 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC106782.6-201ENST00000611264 512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 COG2-201ENST00000366668 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 ZEB2-215ENST00000465070 2949 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AL390195.2-201ENST00000564771 2023 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC008817.1-201ENST00000504215 1562 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 SOSTDC1-202ENST00000396652 2411 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 ABCF2P1-201ENST00000465687 1867 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
C4orf17Q53FE4 C2orf91-201ENST00000378711 3721 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 NTRK3-201ENST00000317501 3826 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 ZNF80-203ENST00000619534 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 LINC00676-201ENST00000416090 474 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
C4orf17Q53FE4 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms