Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CTLA4-204ENST00000472206 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 GAPDHP60-201ENST00000513846 995 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC103855.2-202ENST00000527642 568 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC020611.1-201ENST00000537101 254 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PCED1B-AS1-205ENST00000548222 625 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ASB9P1-201ENST00000557146 793 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PHF5CP-201ENST00000591298 325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 SCMH1-204ENST00000361705 3115 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TRPM3-202ENST00000357533 5145 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 NPIPB13-202ENST00000543463 1342 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PTPRN-204ENST00000423636 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 NEK10-204ENST00000383771 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 NME6-214ENST00000452211 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 TMOD1-203ENST00000395211 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 AC103764.1-201ENST00000505083 2096 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 KCNJ3-203ENST00000544049 4523 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
HOXD11P31277 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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HOXD11P31277 ZSCAN26-202ENST00000421553 2835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 KLF7-203ENST00000421199 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PRRX1-201ENST00000239461 4284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 ENPP7P4-201ENST00000487446 1086 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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HOXD11P31277 AC008632.1-201ENST00000519400 753 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 ASB8-211ENST00000539528 839 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AC007907.1-201ENST00000557953 451 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MIR3125-201ENST00000579927 78 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 FXYD3-213ENST00000605552 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 OPRM1-208ENST00000434900 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LRRTM4-202ENST00000409093 2247 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 LEXM-202ENST00000371273 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 HCG22-208ENST00000565192 1675 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 NXPE1-202ENST00000424269 1896 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 PREX2-201ENST00000288368 10750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
HOXD11P31277 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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