Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
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COL4A6Q14031 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
COL4A6Q14031 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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