Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 USP17L21-202ENST00000621388 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R3A-205ENST00000490467 1782 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC051619.3-201ENST00000560646 2426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 GDNF-AS1-203ENST00000514532 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS9-206ENST00000436483 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 MYRFL-205ENST00000552032 3139 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 AC008629.3-201ENST00000505786 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CNTNAP3Q9BZ76 MED23-209ENST00000539158 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM66-202ENST00000402157 10086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 VPS45-201ENST00000369128 2224 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 PREPL-204ENST00000409272 3030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 LINC02026-201ENST00000397645 1615 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 SNORA58.1-201ENST00000364133 136 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CNTNAP3Q9BZ76 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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