Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GSDMB-202ENST00000360317 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CCDC85BQ15834 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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