Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
SREBF2Q12772 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms