Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AP001527.1-201ENST00000566440 1957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC013399.1-201ENST00000450311 418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
PTPRZ1P23471 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRZ1P23471 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms