Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms