Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
FAM187BQ17R55 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
FAM187BQ17R55 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms