Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC010200.1-201ENST00000547380 1454 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 YES1-205ENST00000584307 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF174-203ENST00000571936 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FLI1-202ENST00000344954 3427 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AMPD3-208ENST00000528723 2753 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MGC27382-202ENST00000436742 1993 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SLC24A2-201ENST00000286344 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SMCP-201ENST00000368765 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
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MKRN3Q13064 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC022695.2-201ENST00000518042 768 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ADH7-205ENST00000482593 1420 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FAM9C-201ENST00000333995 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LNP1-203ENST00000489752 1813 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL353583.1-201ENST00000624195 1855 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NSD1-216ENST00000638627 1866 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC113189.6-201ENST00000636696 3591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 NLRP4-201ENST00000301295 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EFNA5-201ENST00000333274 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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