Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
RGPD3A6NKT7 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 MED12-202ENST00000374080 6795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RGPD3A6NKT7 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms