Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUBP2Q9Y5Y2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms