Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms