Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms