Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM35Q9UPQ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms