Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DSEQ9UL01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSEQ9UL01 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms