Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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RABGEF1Q9UJ41 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABGEF1Q9UJ41 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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