Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT7Q9UIV1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT7Q9UIV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT7Q9UIV1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT7Q9UIV1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT7Q9UIV1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms