Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUF60Q9UHX1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms