Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP25Q9UHP3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms