Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWAP70Q9UH65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWAP70Q9UH65 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms