Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
REREQ9P2R6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
REREQ9P2R6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms